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NAD+/NADH 비율 변화를 이용한 미토콘드리아 품질 관리(Mitophagy) 조절 합성 유전자 회로 설계

본 주제는 세포의 에너지 상태를 반영하는 NAD+/NADH 비율 변화를 이용하여, 손상된 미토콘드리아를 제거하는 Mitophagy 과정을 정밀하게 제어하는 합성생물학 적 유전자 회로 설계 원리를 다룹니다. 회로 설계 원리 센싱 모듈: 세포 내 산화환원 상태 를 측정하기…

2일 전 3 aginglab
대사체 신호 기반의 미토콘드리아 기능 장애 감지 및 세포 운명 전환 시스템 모델링

본 시스템은 세포 내 대사체 수준의 변화, 특히 미토콘드리아 기능 저하로 발생하는 특정 대사 산물의 축적을 감지하여 세포의 운명을 결정하는 시스템 생물학 적 회로를 모델링한다. 작동 원리 미토콘드리아 기능 장애 시 발생하는 ATP/ADP 비율 변화 및 특정 대사 중간체…

2일 전 3 aginglab
PCA (Principal Component Analysis)

PCA(Principal Component Analysis), 즉 주성분 분석은 고차원 데이터에서 정보 손실을 최소화하면서 데이터의 차원을 축소하는 비지도 학습 기법입니다. 핵심 개념 데이터의 분산이 가장 큰 방향을 찾아 새로운 축인 주성분(Principal Compo…

2일 전 1 aginglab
Harmony

Harmony 하모니(Harmony) 는 여러 개의 독립적인 요소들이 조화롭고 일관성 있게 결합되어 통일된 상태나 구조를 의미하는 광범위한 개념이다. 과학 분야에서 하모니는 시스템 내의 상호작용 및 균형 상태를 설명할 때 사용되며, 이는 종종 안정성과 효율성의 지표가 …

2일 전 2 aginglab
CCA (Canonical Correlation Analysis)

CCA(Canonical Correlation Analysis), 즉 정준 상관 분석은 두 개 이상의 변수 집합 간의 최대 공분산 관계를 찾는 다변량 통계 기법입니다. 핵심 개념 두 변수 집합 X와 Y 사이에서 가장 높은 상관관계 를 가지는 선형 결합(정준 변수) 쌍들…

2일 전 1 aginglab
단일세포 공간 전사체학 데이터셋의 배치 효과 제거를 위한 통계적 정규화 방법론

단일세포 공간 전사체학 데이터는 다양한 실험 조건 및 기술적 요인으로 인해 발생하는 배치 효과(Batch Effect) 문제를 포함하며, 이는 생물학적 신호 해석을 저해한다. 따라서 데이터의 비교 가능성을 확보하기 위한 엄격한 통계적 정규화가 필수적이다. 주요 정규화 …

2일 전 1 aginglab
세포운명결정

세포운명결정(Cell Fate Determination)이란 개별 세포가 분열하거나 분화하는 과정에서 특정한 종류의 세포(예: 신경세포, 근육세포 등)로 발달할 운명을 확정하는 생물학적 과정을 의미합니다. 핵심 메커니즘 초기 배아 발생 단계에서는 세포들이 주변 환경 및…

2일 전 2 aginglab
공간 전사체학 기반 리보핵단백질(RNP) 복합체의 세포 소기관별 분포 분석

공간 전사체학 은 조직 내 특정 위치에 존재하는 유전자 발현 정보를 제공하며, 이를 통해 리보핵단백질(RNP) 복합체 가 세포 내 어느 소기관(예: 핵, 세포질, 미토콘드리아 등)에 집중되어 있는지 시각적으로 분석할 수 있게 합니다. 분석의 의의 특정 mRNA 의 번역…

2일 전 2 aginglab
미토콘드리아 내 \β-산화 산물에 의한 세포질 아세틸-CoA 풀 조절 메커니즘

본 메커니즘은 미토콘드리아에서 발생하는 지방산 의 \β-산화 과정을 통해 생성되는 부산물이 세포질의 아세틸-CoA 공급량과 후성유전적 조절에 어떻게 영향을 미치는지 설명한다. 핵심 조절 단계 미토콘드리아 내에서 지방산이 분해되면 \β-산화 산물이 생성되며, 이는 일부가…

2일 전 1 aginglab
특정 조건 하에서의 단백질-핵산 상호작용 인터페이스의 구조적 안정성 분석

본 문서는 외부 환경 요인(예: 온도, pH, 이온 강도) 변화가 특정 단백질-핵산 상호작용 인터페이스의 3차원 구조적 안정성에 미치는 영향을 연구한다. 연구 초점 특정 전사 인자 가 DNA 결합 시 나타내는 구조적 변화와 그 안정성 변화를 분자 동역학 시뮬레이션을 통…

2일 전 1 aginglab
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